Read_Me

○ このディレクトリ内のファイルについての説明

　このディレクトリに置いてあるファイルは、PDB (Protein Data Bank) より
　ダウンロードしたものをそのまま、あるいは適宜加工を加えたものです。
　下方に表示されている「.html」ファイルへのリンクをクリックして開いてください。


○ これらのファイルの使用法

　これらのファイルを表示するためには、ChemscapeChime のインストールされた
　環境において、ウェブブラウザで開くことが必要です。
　ChemscapeChime のインストールについては、上位ディレクトリの Read_Me 等を
　参照してください。
　また、Windows XP などで、クリック時にアラートが表示されて分子の構造が
　表示されない場合は「ブロックされているコンテンツを許可」してください。
　
　
○ 表示の変更

  画像上でマウス左ボタンを使ってドラッグすることで、画像を自由に回転させる
  ことができます。また、画像上で右クリックしてメニューを表示させることで、
  画像回転のアニメーションを on/off したり、表示の形式を「wireframe」（結合）、
  「ball&stick」（原子と結合）、「Ribbons」（ペプチド結合をリボン状に表した
  もの）などと変えたり、色を「CPK」（元素ごとの着色、分子模型と同じ色）、
  「Group」（鎖状に結合した高分子の一端からもう一端までグラデーションで着色）。
  「Chain」（共有結合で連なった高分子ごとに着色）などに変えることができます。
  何に注目するかで表示の形式や色を選べばよいのですが、デフォールトでは
  このページの作成者が見やすいと思った方法にあわせてあります。
  いろいろと変えて試してみてください。
  

○ 参考 URI
　http://www.rcsb.org/pdb/
　 Protein Data Bank
　http://www.cs.kyoto-wu.ac.jp/~konami/chem/molecules/
　 生体分子の構造 （京都女子大　小波先生のページ）
　このページの下位には丁寧な Chime のマニュアルもあります。


○ この ReadMe ファイルの作成者、作成日
　　　群馬高専 物質工学科 中島敏
　　　2007.04.24
　　　2007.05.07 (PDBファイルの追加）

Index of /phys/jugyou/molecule/mol_files/pdb/

Parent Directory
1K8J.html DNA 二重螺旋
1DXA.html ベンゾピレンジオールエポキシドの挿入された DNA
1JRW.html 不対塩基によるふくらみ（バルジ）のついた DNA
1JES.html 逆螺旋 DNA
1ZFT.html リボザイム
1MME.html リボザイム
1XST.html リボヌクレアーゼ中の RNA 部分
2JEG.html DNA ポリメラーゼ
1G08.html ヘモグロビン（四量体タンパク）
2PPS.html 光合成反応中心-Iとアンテナ系
1Z9K.html 紅色細菌光合成反応中心
1Z9K-2.html 紅色細菌光合成反応中心の色素配置
1IGT.html 免疫グロブリン
2H13.html ヒストン修飾タンパク質
2IUU.html 六量体タンパク質
1BL8.html カリウム・イオンチャネル
1EMA.html オワンクラゲ緑色蛍光タンパク質
3HHR.html ヒト成長ホルモンとホルモン受容体
1HHH.html 抗原タンパク
1SLQ.html ウィルス由来スパイク様蛋白質
1OHG.html バクテリオファージのキャプシド６角構造
1NOV.html ノダウィルス由来キャプシド蛋白
2C9F.html アデノウィルス由来キャプシド蛋白
1HB5.html バクテリオファージのキャプシド

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